林清尘与黄粱结伴而行，在宗门边缘的小镇再次遇到血脉纯度提升后实力突破的洛云汐。黄粱惊讶林清尘与洛云汐的关系，十分暧昧的挑衅林清尘，让他既是恼火又有些欣喜。
三人决定动身离开，来到一处小村庄时，看到了许多人聚集在某处议论着，随后听闻到诡异的传闻，林清尘等人决定在这里留下来消灭诡异的妖兽，在铲除祸害这里的妖兽后，在恢复意识后以及团队实力得到强大的提升后，林清尘一行人又开始了新的旅程，前往杭城寻找洛云汐所需要的黑陨铁和墨石制成地阶妖刀，在杭城中因为心中的正义和怜悯出手帮助被仇人追杀的小女孩，林清尘等人与杭城的凌家交恶，从小女孩的口中得知，凌家为了拿到女孩家族中的地阶中级之剑—星陨剑，将她家族人全部灭掉，只有她侥幸逃了出来，不过还是被发现了，于是林清尘一行人决定帮助女孩找到被女孩父亲封印在某处的星陨剑，在几番努力的寻找后，终于找到了星陨剑的埋藏地点，可是女孩却一直拔不出来，由于黄粱在之前不小心的暴露行踪，引得凌家四位强者前来，林清尘以一敌二勉强打成平手，关键时刻星陨剑自动飞出来到林清尘手中，在星陨剑的威力下四位强者当场陨落。在此之后林清尘将星陨剑交还给女孩时女孩摇头拒绝，说星陨剑已经认主，任何人都没法使用。林清尘等人只能接受。随即女孩带领三人在交易区内通过等价丹药的交换，得到了墨石，又在临别前林清尘将玉佩内的一丝灵气趁着女孩不注意注入到身体后离去，他相信，在未来的某一天，一定会再次遇到这位女孩。三人再度踏上旅途，前往晋江城，参加城中四年一次的炼丹大会，在重重考验下，林清尘终于夺得冠军，得到了一品灵晶丹丹方，随即炼制出三枚灵晶丹，待到日后突破之时给大家服用。在晋江城内，林清尘感受到了玉石另一片，他跟着找寻发现玉石另一片就在参与炼丹大会的一位炼丹师手上，他是之前与林清尘竞争冠军的人选，林清尘提出要他让出玉石，炼丹师表示可以，但是需要林清尘去完成一件事，那就是去晋江城主的府中带出城主小姐，林清尘用冠军的身份去参加宴请，向城主小姐传达了消息，原来这位炼丹师本来是与小姐自幼相识，但城主一直不同意二人在一起，多方为难，更提出要炼丹师获得比赛的冠军，没想到被林清尘打乱了他们的计划。林清尘三人帮助他两逃走，在路上被城主阻截，城主坦言自己以将小姐嫁与凌家，断不可违背与凌家的誓约，这会给他们带来灾难。小姐宁死不嫁，服毒于当场，炼丹师抱着尸体离开。原来小姐是林清尘他们安排的假死，炼丹师将玉石碎片交给了林清尘。与此同时，之前的凌家族长和三位长老前来闻声赶来报仇，一场大战再度爆发。在激烈的冲突中，林清尘拼死力战，四位强者当场陨落。这一幕被暗中观察着的两位神秘强者看到低头窃窃私语…
在此之后，林清尘二人闯荡御仙大陆时，发现被释放的幽冥谷修士竟停留小镇，暗中探听，得知幽冥谷掌握了一个神话异诀的线索。
林清尘三人决定尾随，伺机夺得神话异诀，不想在云荒山脉行踪暴露，被幽冥谷大师兄等人发现，反遭追杀。
洛云汐被幽冥谷长老偷袭重创，林清尘两人拼命搭救，救下洛云汐，向山脉深处逃去。
林清尘得知一个隐士医术高明，带着洛云汐去找寻那名隐士，隐士铁血心肠不愿意救治陌生人，林清尘跪在雨中求隐士救她一命，隐士被感动，医治了洛云汐，而后他们被幽冥谷修士利用，成了探路的炮灰。接连几日追杀，秘境出现，众人一同闯入机关秘境，隐藏暗中的势力也涌入秘境。
秘境上演各方混战，而林清尘之前所救过的逍遥宗弟子所送的书信就是关于神话异诀的线索，由此也引得逍遥宗宗主率领几位长老秘密加入。林清尘闯入秘境深处，通过秘境考验，得到雷属神话异诀。同时，在秘境中，他也无意中找到了最后一块玉石的碎片，但是当他将玉石拼一起后，发现仍然看不懂玉石纹路中的奥秘。离开秘境后各方势力追杀不断，三人向云荒山脉外逃往，却被幽冥谷长老截住去路，擒下洛云汐威胁两人。
林清尘利用神话异诀拓本交换，交易完成对方反悔，林清尘早有预料，保护洛云汐且战且退。而假的雷神话异诀在幽冥谷长老手上，也引得逍遥殿殿主亲自动手，在混乱中，林清尘趁着两方混战之际逃走，不料逃往中被幻阵迷惑，误入一处恐怖的煞气弥漫的坟冢。
坟冢埋葬无数妖兽的骸骨，随着林清尘等人闯入，纷纷复活。三人辗转奔逃，却始终被困在幻阵中，林清尘终于察觉到被人挖掘开的坟冢入口，进入其中，撞见了想要利用三人牵制阴尸的盗墓贼——白鹿。
白鹿被制服，只能如实讲述他知晓的一切，众人封闭入口，暂时挡住阴尸，前往坟冢深处，通过重重阴尸、阵法的阻拦，得到了黑暗噬神轮，林清尘得到神器认主，被几千年来积蓄的灵力反补，实力暴增。
神器被拿走，坟冢坍塌，诸多阴尸失去了神器煞气的滋养化为飞灰，幻阵也缺失了能量源自动破碎。
众人逃出生天，横穿云荒山脉，来到另一端万剑宗世代镇守的斩生崖禁地。众人在斩生涯的山涧中遇到一汪温泉，黄粱提议到温泉中洗一洗身上的污泥，林清尘和洛云汐觉得麻烦，便提出在一再往前走走探路，让黄粱赶紧跟上。结果在黄粱下水后不久，水中却突然又冒出了一位青衣少女的身影，这人正是圣女曦瑶，她大喊一声，黄粱也吓的不轻，两人尴尬的游往岸边，曦瑶穿好衣服后，指责黄粱是潜入这里的贼，拿剑要杀他，并且划伤了他的手臂。黄粱急忙解释，结果话语笨拙，越描越黑。林清尘听到这边的动静赶紧前来，这才向曦瑶解释清楚，他们并无恶意，只是途经此处。为了证明自己的清白，他们跟着曦瑶来到了她的居所，并且参加了当时举行的宴请。
不想宴会中，禁地真被人闯入，更释放了被封印数千年的上古魔兽。万剑宗派出众多强者前去镇压，反遭魔兽屠戮，曦瑶的姐姐也被魔兽重创。
林清尘等人出手相助，可惜皆不是对手。在林清尘有生命危险之时，隐约听到有种沉闷的声音在向自己问答，在听到了林清尘的回答后，体内神力冲破封印，神主意识暴走的状态下，通过超加速，一招抹杀魔兽，而在此刻，林清尘也开始有了一点自己的意识。随即灾难结束，但释放魔兽的神秘人早已消失无踪。
来到启明王朝的都城，准备参加了不久后的一场拍卖会，曦瑶掌握的消息就是压轴重宝的古图，就是记载风神异诀的地图。
但不等到拍卖会开始，珍宝阁阁主就成古图的主人，免费将一张张复制的地图送给了会场中的众人。
直到拍卖会结束，林清尘分享古图的神秘人，就是当初在万剑宗释放魔兽的那人。林清尘独自追出启明城，遭神秘人伏击，幸亏洛云汐众人及时赶来，逼退了神秘人。
林清尘察觉到阴谋，但各大势力对古图十分看重，联手推算出古图记载的秘境所在之地，竟是启明王朝凶名赫赫的夜幕城。
各圣地、宗门纷纷出动，启明王朝大军也在五王子——靖雷宵的调动下，包围了夜幕城，林清尘等人隐藏在散修中浑水摸鱼。
众多修士进入夜幕城，城中游荡的无数亡者掀起恐怖的尸潮扑杀进入者，更是有保留了神志的尸修隐藏在尸潮中偷袭众多修士。各方联手将尸潮击溃，才众多尸修见势不妙早已在尸潮的保护下退入秘境中。
秘境中更为凶险，靖雷宵被神秘人偷袭重伤，林清尘等人出手拦下神秘人，终于揭穿他的身份御仙大陆天骄——洛天泽。
对方得到上古尸王传承，已经变得不人不尸，只想要得到强大的力量，涉及了一切阴谋，这里没有风神异诀，但有万毒殒神匕被封印在秘境中。
经过大战，将洛天泽重创，夺得万毒殒神匕，摧毁了洛天泽的阴谋，他培养的诸多尸修手下也被全灭。但洛天泽压降林清尘拥有两大上古神兵以及雷神异诀的消息传了出去，诸多势力图谋杀人夺宝，林清尘等人只能悄无声息离开夜幕城。
不久后，启明王朝大将军带领援兵来到夜幕城保护受创的靖雷宵，而靖雷宵返回启明城不久独自离开，开始了自己的历练之路。
在途径神人山脉时，听到附近城中散修讲述神人山脉的异象，林清尘等人好奇前往探查。
不料遭遇洛天泽带领沧溟圣地修士强者伏击，一直暗中保护的顾倾倾出现救援，但被跟随沧溟圣地强者一同到来的黑暗魔将打碎神魂。原来此前在洛天泽攻打剑灵宗时，在最后关头，熊熊烈火中，一股剑气冲破九天，开启了一个庞大剑阵，引下雷电，击退了洛天泽，原来剑灵宗在创宗之初，为了避免有朝一日遇到劫难时能保存最后一分实力，当时数位剑祖将剑气被封印在宗内，在遇到生死存亡之际便会展露出这股最后的实力，以存住剑灵宗最后的命脉。这件事连顾倾倾也不知情，于是在这股力量下，顾倾倾没有死，受了重伤存活了下来，她恢复些后，不放心林逸辰，于是出来找寻他，因为不愿暴露给黑暗势力自己还活着的事实，便暗中保护他。
顾倾倾保护林清尘等人逃入神人山脉的禁区后，耗尽最后本源解封林清尘的神力，随后陨落当场。林清尘对洛天泽、黑暗魔将恨意冲天，发誓复仇。
众人的出现，引得禁区中的蛮兽暴动，可怕的兽潮出现想要灭杀几人，被悲愤的林清尘爆发打出生路，逃入神人山脉的一条隧道中。
逐渐深入，才发现神人山脉真的是上古巨人的尸骸所化，他们就在巨人的身体中。诸多寄生的离奇生物复苏，隧道深处还有可怕的煞风不时爆发。几人不断深入，最终见到了守护风神异诀的神秘人，对方还持有厚天葬土这件上古神器，镇压诡异不详的巨人残魂。
神秘人考验众人消灭巨人恶念残魂，众人手段尽出无法，最终被洛云汐发现残魂弱点，利用自己的神血化解巨人恶念残魂，得到了上古神兵厚天葬土以及风神异诀。洛云汐因打斗中失血过多晕倒，林清尘十分担心她的安危，一直守在她身边，向她说出了心中对她一直以来陪伴不离不弃的感谢，和爱恋。洛云汐醒来，他们拥抱在了一起。
几人通过考验，神秘人消失无踪，留下的诸多上古巨人精髓被众人瓜分吸收，林清尘凭借天赋，实力增加最快，连连突破，更利用虚拟对战系统苦修武技、秘术，让他有把握突破沧溟圣地强者在外的堵截，能够杀出一条生路，离开神人山脉。
辗转几番后，林清尘等人终于找到了其他人类修士的踪迹，汇合他们后得知幻城大陆几日前爆发的浩劫。智械一族与御灵骑士团联手，突然封锁了整个幻城大陆，对各方势力发动攻击，借助神话异诀以及上古神兵的力量，众多势力根本无法抵挡，纷纷被毁灭，现如今幸存者们只能四处躲藏。
天界的巅峰仙者出动，带领七位上仙随他统帅上万天兵，降临激战中的幻城大陆。凭借强大的力量与智械一族以及御灵骑士团联手，将隐藏起来的各方势力逐一消灭
林清尘已经被团团包围，幸亏危急时刻之前出现过的女仙再次现身，告知林清尘他的身世之谜，借助仙族掌握的传送手段，将他们送到天界。
天界随着天使族主力离开，守备十分空虚。林清尘等人强袭天牢，救出自己被囚禁的姑姑—沈玉。
此时的御灵世界因为仙族、御灵骑士团、魔族、智械的联手清洗，已经陷入大乱，各族的反抗力量全都汇聚到御仙大陆、青云大陆、神影大陆三地。
林清尘等人返回御仙大陆，遭到天兵们与御灵骑士团伏击，一场大战爆发，诸多可怕的手段将御仙大陆被边荒摧毁。
林清尘等人大战时，魔族、智械两大势力疯狂杀戮，被称为秩序者的神秘强者出现在神影大陆的万丈祭台上，施展秘术开始接驳御灵世界，想要将这个世界重新洗牌，完全清洗所有生灵，几位残存的守护者成为维持空间隧道的能量源。
魔王察觉到不对，为时已晚被抹杀，残存的六位魔王见势不妙，只能投靠秩序者。这里的空间异常以及毁灭气息引起了大战中的林清尘等人注意，纷纷收手赶来此地。
沈玉震惊的认出秩序者的身份，竟是林清尘的父亲——林晓，让所有人震惊。
残酷的大战爆发，受到林晓欺骗的御灵骑士团对其发动攻击，仙族也落寞不已，为了偿还所犯的罪恶，带着心腹杀向触碰到主神境界的林晓。
各方力量联手，对抗林晓以及他培养的庞大势力。林清尘等人根本不敌自己父亲，沈玉也因为世界树占据了徐晓的身体束手束脚，反被重创。
靖雷宵、檒坤、尤沱等人先后战死，被林晓吞噬。林清尘等人燃烧本源驾驭诸多神话异诀以及上古神兵与其搏命，但剩余几个神话异诀以及上古神兵都在自己父亲手中，根本无法战胜他。
在世界即将迎来毁灭的时刻，林晓的意志短暂的抢回了身体的控制，释放被秩序者控制的神话异诀以及上古神兵，为林清尘等人创造毁灭他的机会。
林清尘悲痛不已，最后借助神话异诀抽取他们的力量，压制林晓，最终借助十八上古神兵将其彻底毁灭。